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twitter 拳交 GigaScience是全球数据分享责任的一部分:新圭表允许不同的数据集进行集成
发布日期:2024-09-02 10:34     点击次数:78

twitter 拳交 GigaScience是全球数据分享责任的一部分:新圭表允许不同的数据集进行集成

由牛津大学的揣测东说念主员联结的一组全球30多个科学组织,仍是产生一个共同的圭表,将可能的广漠的和透澈不同的数据库的一致的描写编译规模从基因到干细胞科学、环境揣测。在这个神气中起作用的孝顺者之一是GigaSciencetwitter 拳交,因为咱们觉得它可能相配有助于处理咱们的界限所涵盖的各式数据类型。

新圭表允许当代时间驱动的科学产生的海量数据在幕后进行组合,从而为庸碌不同规模的科学家提供了一种花式来互助彼此的发现。

2012年1月27日,《当然-遗传学》杂志发表了一篇批驳(并在社论中强调了这极少),描写了这种相宜圭表的数据分享费事偏捏在线存在,ISA Commons。

牛津大学电子揣测中心(Oxford e-Research Centre)神气组长、生物分享采集(BioSharing Network)创举东说念主苏珊娜-阿苏塔•桑松(Susanna-Assunta Sansone)默示:“咱们当今正共同费事,提供顾问大宗底本不兼容的数据的妙技,从生物医学到环境。

哈佛大学大众卫生学院(Harvard School of Public Health)生物信息学素养温斯顿•希德(Winston Hide)默示:“哈佛干细胞揣测所(Harvard Stem Cell Institute)的一个例子是,咱们当今不错找到鱼类普通血液干细胞践诺与儿童癌症之间的关联。”

这篇批驳的作家说,有必要修复共同的数据圭表,因为数据和时间的海啸正在冲刷着科学。“当今少见百种新时间出现,但也有好多花式来描写产生的信息,”Sansone说,并指出“咱们不错用不同科学的拼图,当今把这些碎屑拼在沿途,变成一个完满的画面。”

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“我发现这项费事最令东说念主饱读吹的极少是,当今微型揣测小组不错运运用用这个框架来存储践诺室数据,盲从社区圭表,而无需我方有利的生物信息援手。这有点像facebook,允许每个东说念主创建我方的网页——倏得之间,你不需要成为缱绻方面的各人,就不错把你的数据发布到寰宇其他地点,”剑桥大学的Jules Griffin博士说。

欧洲生物信息学揣测所的克里斯托夫•斯坦贝克博士说:“咱们可爱它的地点在于它在不同生物科学规模和机构之间的斡旋性。”

“它也有后劲为大型中心责任twitter 拳交,”BGI和GigaScience的Scott Edmunds说。由于GigaScience的目的是得回尽可能多的“大数据”类型,是以必须处理尽可能多的门径,而由ISA-commons援手的大宗数据类型和创建新竖立的智商可能会科罚这个相配蹙迫的问题。这导致GigaScience成为第一个杂志提供作家聘请以ISA-commons门径提交数据,和这些资源也可用了华大基因揣测院(寰宇上最大的基因组揣测所)开释他们的广漠数目的数据更快更庸碌的揣测社区通过关联GigaDB数据库。



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